架构详解

特性总览

PolarDB PostgreSQL（以下简称 PolarDB）是一款阿里云自主研发的企业级数据库产品，采用计算存储分离架构，兼容 PostgreSQL 与 Oracle。PolarDB 的存储与计算能力均可横向扩展，具有高可靠、高可用、弹性扩展等企业级数据库特性。同时，PolarDB 具有大规模并行计算能力，可以应对 OLTP 与 OLAP 混合负载；还具有时空、向量、搜索、图谱等多模创新特性，可以满足企业对数据处理日新月异的新需求。
PolarDB 支持多种部署形态：存储计算分离部署、X-Paxos 三节点部署、本地盘部署。

传统数据库的问题

随着用户业务数据量越来越大，业务越来越复杂，传统数据库系统面临巨大挑战，如：

  1. 存储空间无法超过单机上限。
  2. 通过只读实例进行读扩展，每个只读实例独享一份存储，成本增加。
  3. 随着数据量增加，创建只读实例的耗时增加。
  4. 主备延迟高。

PolarDB 云原生数据库的优势

image.png 针对上述传统数据库的问题，阿里云研发了 PolarDB 云原生数据库。采用了自主研发的计算集群和存储集群分离的架构。具备如下优势：

  1. 扩展性：存储计算分离，极致弹性。
  2. 成本：共享一份数据，存储成本低。
  3. 易用性：一写多读，透明读写分离。
  4. 可靠性：三副本、秒级备份。

PolarDB 整体架构概述

下面会从两个方面来解读 PolarDB 的架构，分别是：存储计算分离架构、HTAP 架构。

存储计算分离架构概述

image.png PolarDB 是存储计算分离的设计，存储集群和计算集群可以分别独立扩展：

  1. 当计算能力不够时，可以单独扩展计算集群。
  2. 当存储容量不够时，可以单独扩展存储集群。

基于 Shared-Storage 后，主节点和多个只读节点共享一份存储数据，主节点刷脏不能再像传统的刷脏方式了，否则：

  1. 只读节点去存储中读取的页面，可能是比较老的版本，不符合他自己的状态。
  2. 只读节点指读取到的页面比自身内存中想要的数据要超前。
  3. 主节点切换到只读节点时，只读节点接管数据更新时，存储中的页面可能是旧的，需要读取日志重新对脏页的恢复。

对于第一个问题，我们需要有页面多版本能力；对于第二个问题，我们需要主库控制脏页的刷脏速度。

HTAP 架构概述

读写分离后，单个计算节点无法发挥出存储侧大 IO 带宽的优势，也无法通过增加计算资源来加速大的查询。我们研发了基于 Shared-Storage 的 MPP 分布式并行执行，来加速在 OLTP 场景下 OLAP 查询。 PolarDB 支持一套 OLTP 场景型的数据在如下两种计算引擎下使用：

  • 单机执行引擎：处理高并发的 OLTP 型负载。
  • 分布式执行引擎：处理大查询的 OLAP 型负载。

image.png 在使用相同的硬件资源时性能达到了传统 Greenplum 的 90%，同时具备了 SQL 级别的弹性：在计算能力不足时，可随时增加参与 OLAP 分析查询的 CPU，而数据无需重分布。

PolarDB - 存储计算分离架构详解

Shared-Storage 带来的挑战

基于 Shared-Storage 之后，数据库由传统的 share nothing，转变成了 shared storage 架构。需要解决如下问题：

  • 数据一致性：由原来的 N 份计算+N 份存储，转变成了 N 份计算+1 份存储。
  • 读写分离：如何基于新架构做到低延迟的复制。
  • 高可用：如何 Recovery 和 Failover。
  • IO 模型：如何从 Buffer-IO 向 Direct-IO 优化。

架构原理

image.png 首先来看下基于 Shared-Storage 的 PolarDB 的架构原理。

  • 主节点为可读可写节点（RW），只读节点为只读（RO）。
  • Shared-Storage 层，只有主节点能写入，因此主节点和只读节点能看到一致的落盘的数据。
  • 只读节点的内存状态是通过回放 WAL 保持和主节点同步的。
  • 主节点的 WAL 日志写到 Shared-Storage，仅复制 WAL 的 meta 给只读节点。
  • 只读节点从 Shared-Storage 上读取 WAL 并回放。

数据一致性

传统数据库的内存状态同步

传统 share nothing 的数据库，主节点和只读节点都有自己的内存和存储，只需要从主节点复制 WAL 日志到只读节点，并在只读节点上依次回放日志即可，这也是复制状态机的基本原理。

基于 Shared-Storage 的内存状态同步

前面讲到过存储计算分离后，Shared-Storage 上读取到的页面是一致的，内存状态是通过从 Shared-Storage 上读取最新的 WAL 并回放得来，如下图： image.png

  1. 主节点通过刷脏把版本 200 写入到 Shared-Storage。
  2. 只读节点基于版本 100，并回放日志得到 200。

基于 Shared-Storage 的“过去页面”

上述流程中，只读节点中基于日志回放出来的页面会被淘汰掉，此后需要再次从存储上读取页面，会出现读取的页面是之前的老页面，称为“过去页面”。如下图：
image.png

  1. T1 时刻，主节点在 T1 时刻写入日志 LSN=200，把页面 P1 的内容从 500 更新到 600；
  2. 只读节点此时页面 P1 的内容是 500；
  3. T2 时刻，主节点将日志 200 的 meta 信息发送给只读节点，只读节点得知存在新的日志；
  4. T3 时刻，此时在只读节点上读取页面 P1，需要读取页面 P1 和 LSN=200 的日志，进行一次回放，得到 P1 的最新内容为 600；
  5. T4 时刻，只读节点上由于 BufferPool 不足，将回放出来的最新页面 P1 淘汰掉；
  6. 主节点没有将最新的页面 P1 为 600 的最新内容刷脏到 Shared-Storage 上；
  7. T5 时刻，再次从只读节点上发起读取 P1 操作，由于内存中已把 P1 淘汰掉了，因此从 Shared-Storage 上读取，此时读取到了“过去页面”的内容；

“过去页面” 的解法

只读节点在任意时刻读取页面时，需要找到对应的 Base 页面和对应起点的日志，依次回放。如下图：
image.png

  1. 在只读节点内存中维护每个 Page 对应的日志 meta。
  2. 在读取时一个 Page 时，按需逐个应用日志直到期望的 Page 版本。
  3. 应用日志时，通过日志的 meta 从 Shared-Storage 上读取。

通过上述分析，需要维护每个 Page 到日志的“倒排”索引，而只读节点的内存是有限的，因此这个 Page 到日志的索引需要持久化，PolarDB 设计了一个可持久化的索引结构 - LogIndex。LogIndex 本质是一个可持久化的 hash 数据结构。

  1. 只读节点通过 WAL receiver 接收从主节点过来的 WAL meta 信息。
  2. WAL meta 记录该条日志修改了哪些 Page。
  3. 将该条 WAL meta 插入到 LogIndex 中，key 是 PageID，value 是 LSN。
  4. 一条 WAL 日志可能更新了多个 Page（索引分裂），在 LogIndex 对有多条记录。
  5. 同时在 BufferPool 中给该该 Page 打上 outdate 标记，以便使得下次读取的时候从 LogIndex 重回放对应的日志。
  6. 当内存达到一定阈值时，LogIndex 异步将内存中的 hash 刷到盘上。

image.png 通过 LogIndex 解决了刷脏依赖“过去页面”的问题，也是得只读节点的回放转变成了 Lazy 的回放：只需要回放日志的 meta 信息即可。

基于 Shared-Storage 的“未来页面”

在存储计算分离后，刷脏依赖还存在“未来页面”的问题。如下图所示： image.png

  1. T1 时刻，主节点对 P1 更新了 2 次，产生了 2 条日志，此时主节点和只读节点上页面 P1 的内容都是 500。
  2. T2 时刻， 发送日志 LSN=200 给只读节点。
  3. T3 时刻，只读节点回放 LSN=200 的日志，得到 P1 的内容为 600，此时只读节点日志回放到了 200，后面的 LSN=300 的日志对他来说还不存在。
  4. T4 时刻，主节点刷脏，将 P1 最新的内容 700 刷到了 Shared-Storage 上，同时只读节点上 BufferPool 淘汰掉了页面 P1。
  5. T5 时刻，只读节点再次读取页面 P1，由于 BufferPool 中不存在 P1，因此从共享内存上读取了最新的 P1，但是只读节点并没有回放 LSN=300 的日志，读取到了一个对他来说超前的“未来页面”。
  6. “未来页面”的问题是：部分页面是未来页面，部分页面是正常的页面，会到时数据不一致，比如索引分裂成 2 个 Page 后，一个读取到了正常的 Page，另一个读取到了“未来页面”，B+Tree 的索引结构会被破坏。

“未来页面”的解法

“未来页面”的原因是主节点刷脏的速度超过了任一只读节点的回放速度（虽然只读节点的 Lazy 回放已经很快了）。因此，解法就是对主节点刷脏进度时做控制：不能超过最慢的只读节点的回放位点。如下图所示：
image.png

  1. 只读节点回放到 T4 位点。
  2. 主节点在刷脏时，对所有脏页按照 LSN 排序，仅刷在 T4 之前的脏页(包括 T4)，之后的脏页不刷。
  3. 其中，T4 的 LSN 位点称为“一致性位点”。

低延迟复制

传统流复制的问题

  1. 同步链路：日志同步路径 IO 多，网络传输量大。
  2. 页面回放：读取和 Buffer 修改慢（IO 密集型 + CPU 密集型）。
  3. DDL 回放：修改文件时需要对修改的文件加锁，而加锁的过程容易被阻塞，导致 DDL 慢。
  4. 快照更新：RO 高并发引起事务快照更新慢。

如下图所示： image.png

  1. 主节点写入 WAL 日志到本地文件系统中。
  2. WAL Sender 进程读取，并发送。
  3. 只读节点的 WAL Receiver 进程接收写入到本地文件系统中。
  4. 回放进程读取 WAL 日志，读取对应的 Page 到 BufferPool 中，并在内存中回放。
  5. 主节点刷脏页到 Shared Storage。

可以看到，整个链路是很长的，只读节点延迟高，影响用户业务读写分离负载均衡。

优化 1 - 只复制 Meta

因为底层是 Shared-Storage，只读节点可直接从 Shared-Storage 上读取所需要的 WAL 数据。因此主节点只把 WAL 日志的元数据（去掉 Payload）复制到只读节点，这样网络传输量小，减少关键路径上的 IO。如下图所示：
image.png

  1. WAL Record 是由：Header，PageID，Payload 组成。
  2. 由于只读节点可以直接读取 Shared-Storage 上的 WAL 文件，因此主节点只把 WAL 日志的元数据发送（复制）到只读节点，包括：Header，PageID。
  3. 在只读节点上，通过 WAL 的元数据直接读取 Shared-Storage 上完整的 WAL 文件。

通过上述优化，能显著减少主节点和只读节点间的网络传输量。从下图可以看到网络传输量减少了 98%。 image.png

优化 2 - 页面回放优化

在传统 DB 中日志回放的过程中会读取大量的 Page 并逐个日志 Apply，然后落盘。该流程在用户读 IO 的关键路径上，借助存储计算分离可以做到：如果只读节点上 Page 不在 BufferPool 中，不产生任何 IO，仅仅记录 LogIndex 即可。
可以将回放进程中的如下 IO 操作 offload 到 session 进程中：

  1. 数据页 IO 开销。
  2. 日志 apply 开销。
  3. 基于 LogIndex 页面的多版本回放。

如下图所示，在只读节点上的回放进程中，在 Apply 一条 WAL 的 meta 时： image.png

  1. 如果对应 Page 不在内存中，仅仅记录 LogIndex。
  2. 如果对应的 Page 在内存中，则标记为 Outdate，并记录 LogIndex，回放过程完成。
  3. 用户 session 进程在读取 Page 时，读取正确的 Page 到 BufferPool 中，并通过 LogIndex 来回放相应的日志。
  4. 可以看到，主要的 IO 操作有原来的单个回放进程 offload 到了多个用户进程。

通过上述优化，能显著减少回放的延迟，比 AWS Aurora 快 30 倍。 image.png

优化 3 - DDL 锁回放优化

在主节点执行 DDL 时，比如：drop table，需要在所有节点上都对表上排他锁，这样能保证表文件不会在只读节点上读取时被主节点删除掉了（因为文件在 Shared-Storage 上只有一份）。在所有只读节点上对表上排他锁是通过 WAL 复制到所有的只读节点，只读节点回放 DDL 锁来完成。
而回放进程在回放 DDL 锁时，对表上锁可能会阻塞很久，因此可以通过把 DDL 锁也 offload 到其他进程上来优化回访进程的关键路径。
image.png 通过上述优化，能够回放进程一直处于平滑的状态，不会因为去等 DDL 而阻塞了回放的关键路径。
image.png 上述 3 个优化之后，极大的降低了复制延迟，能够带来如下优势：

  • 读写分离：负载均衡，更接近 Oracle RAC 使用体验。
  • 高可用：加速 HA 流程。
  • 稳定性：最小化未来页的数量，可以写更少或者无需写页面快照。

Recovery 优化

背景

数据库 OOM、Crash 等场景恢复时间长，本质上是日志回放慢，在共享存储 Direct-IO 模型下问题更加突出。
image.png

Lazy Recovery

前面讲到过通过 LogIndex 我们在只读节点上做到了 Lazy 的回放，那么在主节点重启后的 recovery 过程中，本质也是在回放日志，那么我们可以借助 Lazy 回放来加速 recovery 的过程：
image.png

  1. 从 checkpoint 点开始逐条去读 WAL 日志。
  2. 回放完 LogIndex 日志后，即认为回放完成。
  3. recovery 完成，开始提供服务。
  4. 真正的回放被 offload 到了重启之后进来的 session 进程中。

优化之后（回放 500MB 日志量）：
image.png

Persistent BufferPool

上述方案优化了在 recovery 的重启速度，但是在重启之后，session 进程通过读取 WAL 日志来回放想要的 page。表现就是在 recovery 之后会有短暂的响应慢的问题。优化的办法为在数据库重启时 BufferPool 并不销毁，如下图所示：crash 和 restart 期间 BufferPool 不销毁。
image.png 内核中的共享内存分成 2 部分：

  1. 全局结构，ProcArray 等。
  2. BufferPool 结构；其中 BufferPool 通过具名共享内存来分配，在进程重启后仍然有效。而全局结构在进程重启后需要重新初始化。

image.png 而 BufferPool 中并不是所有的 Page 都是可以复用的，比如：在重启前，某进程对 Page 上 X 锁，随后 crash 了，该 X 锁就没有进程来释放了。因此，在 crash 和 restart 之后需要把所有的 BufferPool 遍历一遍，剔除掉不能被复用的 Page。另外，BufferPool 的回收依赖 k8s。
该优化之后，使得重启前后性能平稳。 image.png

PolarDB - HTAP 架构详解

PolaDB 读写分离后，由于底层是存储池，理论上 IO 吞吐是无限大的。而大查询只能在单个计算节点上执行，单个计算节点的 CPU/MEM/IO 是有限的，因此单个计算节点无法发挥出存储侧的大 IO 带宽的优势，也无法通过增加计算资源来加速大的查询。我们研发了基于 Shared-Storage 的 MPP 分布式并行执行，来加速在 OLTP 场景下 OLAP 查询。

HTAP 架构原理

PolarDB 底层存储在不同节点上是共享的，因此不能直接像传统 MPP 一样去扫描表。我们在原来单机执行引擎上支持了 MPP 分布式并行执行，同时对 Shared-Storage 进行了优化。 基于 Shared-Storage 的 MPP 是业界首创，它的原理是：

  1. Shuffle 算子屏蔽数据分布。
  2. ParallelScan 算子屏蔽共享存储。

image.png 如图所示：

  1. 表 A 和表 B 做 join，并做聚合。
  2. 共享存储中的表仍然是单个表，并没有做物理上的分区。
  3. 重新设计 4 类扫描算子，使之在扫描共享存储上的表时能够分片扫描，形成 virtual partition。

分布式优化器

基于社区的 GPORCA 优化器扩展了能感知共享存储特性的 Transformation Rules。使得能够探索共享存储下特有的 Plan 空间，比如：对于一个表在 PolarDB 中既可以全量的扫描，也可以分区域扫描，这个是和传统 MPP 的本质区别。
图中，上面灰色部分是 PolarDB 内核与 GPORCA 优化器的适配部分。
下半部分是 ORCA 内核，灰色模块是我们在 ORCA 内核中对共享存储特性所做的扩展。
image.png

算子并行化

PolarDB 中有 4 类算子需要并行化，下面介绍一个具有代表性的 Seqscan 的算子的并行化。为了最大限度的利用存储的大 IO 带宽，在顺序扫描时，按照 4MB 为单位做逻辑切分，将 IO 尽量打散到不同的盘上，达到所有的盘同时提供读服务的效果。这样做还有一个优势，就是每个只读节点只扫描部分表文件，那么最终能缓存的表大小是所有只读节点的 BufferPool 总和。 image.png 下面的图表中：

  1. 增加只读节点，扫描性能线性提升 30 倍。
  2. 打开 Buffer 时，扫描从 37 分钟降到 3.75 秒。

image.png

消除数据倾斜问题

倾斜是传统 MPP 固有的问题：

  1. 在 PolarDB 中，大对象的是通过 heap 表关联 TOAST​ 表，无论对哪个表切分都无法达到均衡。
  2. 另外，不同只读节点的事务、buffer、网络、IO 负载抖动。

以上两点会导致分布执行时存在长尾进程。
image.png

  1. 协调节点内部分成 DataThread 和 ControlThread。
  2. DataThread 负责收集汇总元组。
  3. ControlThread 负责控制每个扫描算子的扫描进度。
  4. 扫描快的工作进程能多扫描逻辑的数据切片。
  5. 过程中需要考虑 Buffer 的亲和性。

需要注意的是：尽管是动态分配，尽量维护 buffer 的亲和性；另外，每个算子的上下文存储在 worker 的私有内存中，Coordinator 不存储具体表的信息；

下面表格中，当出现大对象时，静态切分出现数据倾斜，而动态扫描仍然能够线性提升。
image.png

SQL 级别弹性扩展

那我们利用数据共享的特点，还可以支持云原生下极致弹性的要求：把 Coordinator 全链路上各个模块所需要的外部依赖存在共享存储上，同时 worker 全链路上需要的运行时参数通过控制链路从 Coordinator 同步过来，使 Coordinator 和 worker 无状态化。
image.png 因此：

  1. SQL 连接的任意只读节点都可以成为 Coordinator 节点，这解决了 Coordinator 单点问题。
  2. 一个 SQL 能在任意节点上启动任意 worker 数目，达到算力能 SQL 级别弹性扩展，也允许业务有更多的调度策略：不同业务域同时跑在不同的节点集合上。 image.png

事务一致性

多个计算节点数据一致性通过等待回放和 globalsnapshot 机制来完成。等待回放保证所有 worker 能看到所需要的数据版本，而 globalsnapshot 保证了选出一个统一的版本。 image.png

TPCH 性能 - 加速比

image.png 我们使用 1TB 的 TPCH 进行了测试，首先对比了 PolarDB 新的分布式并行和单机并行的性能：有 3 个 SQL 提速 60 倍，19 个 SQL 提速 10 倍以上；
image.pngimage.png 另外，使用分布式执行引擎测，试增加 CPU 时的性能，可以看到，从 16 核和 128 核时性能线性提升； 单看 22 条 SQL，通过该增加 CPU，每个条 SQL 性能线性提升。

TPCH 性能 - 和 Greenplum 的对比

和传统 MPP 的 Greenplum 的对比，同样使用 16 个节点，PolarDB 的性能是 Greenplum 的 90%。 image.pngimage.png 前面讲到我们给 PolarDB 的分布式引擎做到了弹性扩展，数据不需要充分重分布，当 dop=8 时，性能是 Greenplum 的 5.6 倍。

分布式执行加速索引创建

OLTP 业务中会建大量的索引，经分析建索引过程中：80%是在排序和构建索引页，20%在写索引页。通过使用分布式并行来加速排序过程，同时流水化批量写入。 image.png 上述优化能够使得创建索引有 4~5 倍的提升。 image.png

分布式并行执行加速多模 - 时空数据库

PolarDB 是对多模数据库，支持时空数据。时空数据库是计算密集型和 IO 密集型，可以借助分布式执行来加速。我们针对共享存储开发了扫描共享 RTREE 索引的功能。 image.png

  • 数据量：40000 万，500 GB
  • 规格：5 个只读节点，每个节点规格为 16 核 CPU、128 GB 内存
  • 性能：
    • 随 CPU 数目线性提升
    • 共 80 核 CPU 时，提升71 倍

image.png

总结

本文从架构层面分析了 PolarDB 的技术要点：

  • 存储计算分离架构。
  • HTAP 架构。

后续文章将具体讨论更多的技术细节，比如：如何基于 Shared-Storage 的查询优化器，LogIndex 如何做到高性能，如何闪回到任意时间点，如何在 Shared-Storage 上支持 MPP，如何和 X-Paxos 结合构建高可用等等，敬请期待。

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贡献者: 北侠, 棠羽