二、特征选择

2.1 过滤式特征选取

2.1.1 VarianceThreshold

  1. VarianceThreshold 用于剔除方差很小的特征,其原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.VarianceThreshold(threshold=0.0)
    • threshold:一个浮点数,指定方差的阈值。低于此阈值的特征将被剔除。
  2. 属性:

    • variances_:一个数组,元素分别是各特征的方差。
  3. 方法:

    • fit(X[, y]):从样本数据中学习每个特征的方差。

    • transform(X):执行特征选择,即删除低于指定阈值的特征。

    • fit_transform(X[, y]):从样本数据中学习每个特征的方差,然后执行特征选择。

    • get_support([indices]):返回保留的特征。

      • 如果indices=True,则返回被选出的特征的索引。
      • 如果indices=False,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
    • inverse_transform(X):根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征的值全部用 0 代替。

2.1.2 SelectKBest

  1. SelectKBest 用于保留统计得分最高的 二、特征选择 - 图1 个特征,其原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.SelectKBest(score_func=<function f_classif>, k=10)
    • score_func:一个函数,用于给出统计指标。

      该函数的参数为 (X,y) ,返回值为(scores,pvalues)

      • X :样本集合。通常是一个numpy array,每行代表一个样本,每列代表一个特征。
      • y :样本的标签集合。它与X 的每一行相对应。
      • scores :样本的得分集合。它与X 的每一行相对应。
      • pvalues:样本得分的p 值。它与X 的每一行相对应。
    • k:一个整数或者字符串'all',指定要保留最佳的几个特征。

      如果为'all',则保留所有的特征。

  2. sklearn提供的常用的统计指标函数为:

    • sklearn.feature_selection.f_regression:基于线性回归分析来计算统计指标,适用于回归问题。
    • sklearn.feature_selection.chi2:计算卡方统计量,适用于分类问题。
    • sklearn.feature_selection.f_classif:根据方差分析Analysis of variance:ANOVA的原理,依靠F-分布为机率分布的依据,利用平方和与自由度所计算的组间与组内均方估计出F值。适用于分类问题 。
  3. 属性:

    • scores_:一个数组,给出了所有特征的得分。
    • pvalues_:一个数组,给出了所有特征得分的p-values
  4. 方法:参考VarianceThreshold

2.1.3 SelectPercentile

  1. SelectPercentile 用于保留统计得分最高的 二、特征选择 - 图2 比例的特征,其原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.SelectPercentile(score_func=<function f_classif>,
    2. percentile=10)
    • score_func:一个函数,用于给出统计指标。参考SelectKBest
    • percentile:一个整数,指定要保留最佳的百分之几的特征,如10表示保留最佳的百分之十的特征
  2. 属性:参考SelectKBest

  3. 方法:参考VarianceThreshold

2.2 包裹式特征选取

2.2.1 RFE

  1. RFE类用于实现包裹式特征选取,其原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.RFE(estimator, n_features_to_select=None,step=1,verbose=0)
    • estimator:一个学习器,它必须提供一个.fit方法和一个.coef_特征。其中.coef_特征中存放的是学习到的各特征的权重系数。

      通常使用SVM和广义线性模型作为estimator参数。

    • n_features_to_select:一个整数或者None,指定要选出几个特征。

      如果为None,则默认选取一半的特征。

    • step:一个整数或者浮点数,指定每次迭代要剔除权重最小的几个特征。

      • 如果大于等于1,则作为整数,指定每次迭代要剔除特征的数量。
      • 如果在0.0~1.0之间,则指定每次迭代要剔除特征的比例。
    • verbose:一个整数,控制输出日志。
  2. RFE要求学习器能够学习特征的权重(如线性模型),其原理为:

    • 首先学习器在初始的特征集合上训练。
    • 然后学习器学得每个特征的权重,剔除当前权重一批特征,构成新的训练集。
    • 再将学习器在新的训练集上训练,直到剩下的特征的数量满足条件。
  3. 属性:

    • n_features_:一个整数,给出了被选出的特征的数量。
    • support_:一个数组,给出了特征是否被选择的mask
    • ranking_:特征权重排名。原始第 i 个特征的排名为 raning_[i]
    • estimator_: 外部提供的学习器 。
  4. 方法:

    • fit(X,y):训练RFE模型

    • transform(X):执行特征选择。

    • fit_transform(X,y):从样本数据中学习RFE模型,然后执行特征选择。

    • get_support([indices]):返回保留的特征。

      • 如果indices=True,则返回被选出的特征的索引。
      • 如果indices=False,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
    • inverse_transform(X):根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征值全部用 0 代替。

    • predict(X)/predict_log_proba(X) /predict_proba(X):将X进行特征选择之后,在使用内部的estimator来预测。

    • score(X, y) :将X进行特征选择之后,训练内部estimator 并对内部的estimator进行评分。

2.2.2 RFECV

  1. RFECVRFE的一个变体,它执行一个交叉验证来寻找最优的剩余特征数量,因此不需要指定保留多少个特征。

  2. RFECV 的原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.RFECV(estimator, step=1, cv=None, scoring=None,verbose=0)
    • cv:一个整数,或者交叉验证生成器或者一个可迭代对象,它决定了交叉验证策略。

      • 如果为None,则使用默认的3折交叉验证。
      • 如果为整数 二、特征选择 - 图3 ,则使用 二、特征选择 - 图4 折交叉验证。
      • 如果为交叉验证生成器,则直接使用该对象。
      • 如果为可迭代对象,则使用该可迭代对象迭代生成训练-测试集合。
    • 其它参数参考RFE
  3. 属性:

    • grid_scores_:一个数组,给出了交叉验证的预测性能得分。其元素为每个特征子集上执行交叉验证后的预测得分。
    • 其它属性参考RFE
  4. 方法:参考RFE

2.3 嵌入式特征选择

  1. SelectFromModel用于实现嵌入式特征选取,其原型为:

    1. class sklearn.feature_selection.SelectFromModel(estimator, threshold=None,
    2. prefit=False)
    • estimator:一个学习器,它可以是未训练的(prefit=False),或者是已经训练好的(prefit=True)。

      estimator 必须有coef_或者feature_importances_属性,给出每个特征的重要性。当某个特征的重要性低于某个阈值时,该特征将被移除。

    • threshold:一个字符串或者浮点数或者None,指定特征重要性的一个阈值。低于此阈值的特征将被剔除。

      • 如果为浮点数,则指定阈值的绝对大小。

      • 如果为字符串,可以是:

        • 'mean':阈值为特征重要性的均值。
        • 'median':阈值为特征重要性的中值。
        • 如果是'1.5*mean',则表示阈值为 1.5 倍的特征重要性的均值。
      • 如果为None

        • 如果estimator有一个penalty参数,且该参数设置为'l1',则阈值默认为1e-5
        • 其他情况下,阈值默认为'mean'
    • prefit:一个布尔值,指定estimator是否已经训练好了。

      如果prefit=False,则estimator是未训练的。

  2. 属性:

    • threshold_:一个浮点数,存储了用于特征选取重要性的阈值。
  3. 方法:

    • fit(X,y):训练SelectFromModel模型。

    • transform(X):执行特征选择。

    • fit_transform(X,y):从样本数据中学习SelectFromModel模型,然后执行特征选择。

    • get_support([indices]):返回保留的特征。

      • 如果indices=True,则返回被选出的特征的索引。
      • 如果indices=False,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
    • inverse_transform(X):根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征值全部用 0 代替。

    • partial_fit(X[, y]):通过部分数据来学习SelectFromModel模型。

      它支持批量学习,这样对于内存更友好。即训练数据并不是一次性学习,而是分批学习。