二、特征选择
2.1 过滤式特征选取
2.1.1 VarianceThreshold
VarianceThreshold
用于剔除方差很小的特征,其原型为:class sklearn.feature_selection.VarianceThreshold(threshold=0.0)
threshold
:一个浮点数,指定方差的阈值。低于此阈值的特征将被剔除。
属性:
variances_
:一个数组,元素分别是各特征的方差。
方法:
fit(X[, y])
:从样本数据中学习每个特征的方差。transform(X)
:执行特征选择,即删除低于指定阈值的特征。fit_transform(X[, y])
:从样本数据中学习每个特征的方差,然后执行特征选择。get_support([indices])
:返回保留的特征。- 如果
indices=True
,则返回被选出的特征的索引。 - 如果
indices=False
,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
- 如果
inverse_transform(X)
:根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征的值全部用 0 代替。
2.1.2 SelectKBest
SelectKBest
用于保留统计得分最高的 个特征,其原型为:class sklearn.feature_selection.SelectKBest(score_func=<function f_classif>, k=10)
score_func
:一个函数,用于给出统计指标。该函数的参数为
(X,y)
,返回值为(scores,pvalues)
。X
:样本集合。通常是一个numpy array
,每行代表一个样本,每列代表一个特征。y
:样本的标签集合。它与X
的每一行相对应。scores
:样本的得分集合。它与X
的每一行相对应。pvalues
:样本得分的p
值。它与X
的每一行相对应。
k
:一个整数或者字符串'all'
,指定要保留最佳的几个特征。如果为
'all'
,则保留所有的特征。
sklearn
提供的常用的统计指标函数为:sklearn.feature_selection.f_regression
:基于线性回归分析来计算统计指标,适用于回归问题。sklearn.feature_selection.chi2
:计算卡方统计量,适用于分类问题。sklearn.feature_selection.f_classif
:根据方差分析Analysis of variance:ANOVA
的原理,依靠F-分布
为机率分布的依据,利用平方和与自由度所计算的组间与组内均方估计出F
值。适用于分类问题 。
属性:
scores_
:一个数组,给出了所有特征的得分。pvalues_
:一个数组,给出了所有特征得分的p-values
。
- 方法:参考
VarianceThreshold
。
2.1.3 SelectPercentile
SelectPercentile
用于保留统计得分最高的 比例的特征,其原型为:class sklearn.feature_selection.SelectPercentile(score_func=<function f_classif>,
percentile=10)
score_func
:一个函数,用于给出统计指标。参考SelectKBest
。percentile
:一个整数,指定要保留最佳的百分之几的特征,如10
表示保留最佳的百分之十的特征
属性:参考
SelectKBest
。方法:参考
VarianceThreshold
。
2.2 包裹式特征选取
2.2.1 RFE
RFE
类用于实现包裹式特征选取,其原型为:class sklearn.feature_selection.RFE(estimator, n_features_to_select=None,step=1,verbose=0)
estimator
:一个学习器,它必须提供一个.fit
方法和一个.coef_
特征。其中.coef_
特征中存放的是学习到的各特征的权重系数。通常使用
SVM
和广义线性模型作为estimator
参数。n_features_to_select
:一个整数或者None
,指定要选出几个特征。如果为
None
,则默认选取一半的特征。step
:一个整数或者浮点数,指定每次迭代要剔除权重最小的几个特征。- 如果大于等于1,则作为整数,指定每次迭代要剔除特征的数量。
- 如果在
0.0~1.0
之间,则指定每次迭代要剔除特征的比例。
verbose
:一个整数,控制输出日志。
RFE
要求学习器能够学习特征的权重(如线性模型),其原理为:- 首先学习器在初始的特征集合上训练。
- 然后学习器学得每个特征的权重,剔除当前权重一批特征,构成新的训练集。
- 再将学习器在新的训练集上训练,直到剩下的特征的数量满足条件。
属性:
n_features_
:一个整数,给出了被选出的特征的数量。support_
:一个数组,给出了特征是否被选择的mask
。ranking_
:特征权重排名。原始第i
个特征的排名为raning_[i]
。estimator_
: 外部提供的学习器 。
方法:
fit(X,y)
:训练RFE
模型transform(X)
:执行特征选择。fit_transform(X,y)
:从样本数据中学习RFE
模型,然后执行特征选择。get_support([indices])
:返回保留的特征。- 如果
indices=True
,则返回被选出的特征的索引。 - 如果
indices=False
,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
- 如果
inverse_transform(X)
:根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征值全部用 0 代替。predict(X)/predict_log_proba(X) /predict_proba(X)
:将X
进行特征选择之后,在使用内部的estimator
来预测。score(X, y)
:将X
进行特征选择之后,训练内部estimator
并对内部的estimator
进行评分。
2.2.2 RFECV
RFECV
是RFE
的一个变体,它执行一个交叉验证来寻找最优的剩余特征数量,因此不需要指定保留多少个特征。RFECV
的原型为:class sklearn.feature_selection.RFECV(estimator, step=1, cv=None, scoring=None,verbose=0)
cv
:一个整数,或者交叉验证生成器或者一个可迭代对象,它决定了交叉验证策略。- 如果为
None
,则使用默认的3
折交叉验证。 - 如果为整数 ,则使用 折交叉验证。
- 如果为交叉验证生成器,则直接使用该对象。
- 如果为可迭代对象,则使用该可迭代对象迭代生成
训练-测试
集合。
- 如果为
- 其它参数参考
RFE
。
属性:
grid_scores_
:一个数组,给出了交叉验证的预测性能得分。其元素为每个特征子集上执行交叉验证后的预测得分。- 其它属性参考
RFE
。
- 方法:参考
RFE
。
2.3 嵌入式特征选择
SelectFromModel
用于实现嵌入式特征选取,其原型为:class sklearn.feature_selection.SelectFromModel(estimator, threshold=None,
prefit=False)
estimator
:一个学习器,它可以是未训练的(prefit=False
),或者是已经训练好的(prefit=True
)。estimator
必须有coef_
或者feature_importances_
属性,给出每个特征的重要性。当某个特征的重要性低于某个阈值时,该特征将被移除。threshold
:一个字符串或者浮点数或者None
,指定特征重要性的一个阈值。低于此阈值的特征将被剔除。如果为浮点数,则指定阈值的绝对大小。
如果为字符串,可以是:
'mean'
:阈值为特征重要性的均值。'median'
:阈值为特征重要性的中值。- 如果是
'1.5*mean'
,则表示阈值为 1.5 倍的特征重要性的均值。
如果为
None
:- 如果
estimator
有一个penalty
参数,且该参数设置为'l1'
,则阈值默认为1e-5
。 - 其他情况下,阈值默认为
'mean'
。
- 如果
prefit
:一个布尔值,指定estimator
是否已经训练好了。如果
prefit=False
,则estimator
是未训练的。
属性:
threshold_
:一个浮点数,存储了用于特征选取重要性的阈值。
方法:
fit(X,y)
:训练SelectFromModel
模型。transform(X)
:执行特征选择。fit_transform(X,y)
:从样本数据中学习SelectFromModel
模型,然后执行特征选择。get_support([indices])
:返回保留的特征。- 如果
indices=True
,则返回被选出的特征的索引。 - 如果
indices=False
,则返回一个布尔值组成的数组,该数组指示哪些特征被选择。
- 如果
inverse_transform(X)
:根据被选出来的特征还原原始数据(特征选取的逆操作),但是对于被删除的特征值全部用 0 代替。partial_fit(X[, y])
:通过部分数据来学习SelectFromModel
模型。它支持批量学习,这样对于内存更友好。即训练数据并不是一次性学习,而是分批学习。