Nebula Algorithm
Nebula Algorithm (简称Algorithm)是一款基于GraphX的Spark应用程序,通过提交Spark任务的形式使用完整的算法工具对Nebula Graph数据库中的数据执行图计算,也可以通过编程形式调用lib库下的算法针对DataFrame执行图计算。
前提条件
在使用 Algorithm 之前,用户需要确认以下信息:
Nebula Graph 服务已经部署并启动。详细信息,参考Nebula Graph安装部署。
Spark 版本为 2.4.x 。
(可选)如果用户需要在Github中克隆最新的Algorithm,并自行编译打包,可以选择安装Maven。
使用限制
点ID的数据必须为整数,即点ID可以是INT类型,或者是String类型但数据本身为整数。
对于非整数的String类型数据,推荐使用调用算法接口的方式,可以使用SparkSQL的dense_rank
函数进行编码,将String类型转换为Long类型。
支持算法
Nebula Algorithm支持的图计算算法如下。
算法名 | 说明 | 应用场景 |
---|---|---|
PageRank | 页面排序 | 网页排序、重点节点挖掘 |
Louvain | 社区发现 | 社团挖掘、层次化聚类 |
KCore | K核 | 社区发现、金融风控 |
LabelPropagation | 标签传播 | 资讯传播、广告推荐、社区发现 |
ConnectedComponent | 联通分量 | 社区发现、孤岛发现 |
StronglyConnectedComponent | 强联通分量 | 社区发现 |
ShortestPath | 最短路径 | 路径规划、网络规划 |
TriangleCount | 三角形计数 | 网络结构分析 |
BetweennessCentrality | 介数中心性 | 关键节点挖掘,节点影响力计算 |
DegreeStatic | 度统计 | 图结构分析 |
实现方法
Nebula Algorithm实现图计算的流程如下:
利用Nebula Spark Connector从Nebula Graph数据库中读取图数据为DataFrame。
将DataFrame转换为GraphX的图。
调用GraphX提供的图算法(例如PageRank)或者自行实现的算法(例如Louvain社区发现)。
详细的实现方法可以参见相关Scala文件。
获取Nebula Algorithm
编译打包
克隆仓库
nebula-spark-utils
。$ git clone -b v2.0.0 https://github.com/vesoft-inc/nebula-spark-utils.git
进入目录
nebula-algorithm
。$ cd nebula-spark-utils/nebula-algorithm
编译打包。
$ mvn clean package -Dgpg.skip -Dmaven.javadoc.skip=true -Dmaven.test.skip=true
编译完成后,在目录nebula-algorithm/target
下生成类似文件nebula-algorithm-2.0.0.jar
。
Maven远程仓库下载
使用方法
调用算法接口(推荐)
lib
库中提供了10种常用图计算算法,用户可以通过编程调用的形式调用算法。
在文件
pom.xml
中添加依赖。<dependency>
<groupId>com.vesoft</groupId>
<artifactId>nebula-algorithm</artifactId>
<version>2.0.0</version>
</dependency>
传入参数调用算法(以PageRank为例)。更多算法请参见测试用例。
val prConfig = new PRConfig(5, 1.0)
val louvainResult = PageRankAlgo.apply(spark, data, prConfig, false)
直接提交算法包
设置配置文件。
``` {
# Spark相关配置
spark: {
app: {
name: LPA
# Spark分片数量
partitionNum:100
}
master:local
}
data: {
# 数据源,可选值为nebula、csv、json。
source: nebula
# 数据落库,即图计算的结果写入的目标,可选值为nebula、csv、json。
sink: nebula
# 算法是否需要权重。
hasWeight: false
}
# Nebula Graph相关配置
nebula: {
# 数据源。Nebula Graph作为图计算的数据源时,nebula.read的配置才生效。
read: {
# 所有Meta服务的IP地址和端口,多个地址用英文逗号(,)分隔。格式: "ip1:port1,ip2:port2"。
# 使用docker-compose部署,端口需要填写docker-compose映射到外部的端口
# 可以用`docker-compose ps`查看
metaAddress: "192.168.*.10:9559"
# Nebula Graph图空间名称
space: basketballplayer
# Nebula Graph边类型, 多个labels时,多个边的数据将合并。
labels: ["serve"]
# Nebula Graph每个边类型的属性名称,此属性将作为算法的权重列,请确保和边类型对应。
weightCols: ["start_year"]
}
# 数据落库。图计算结果落库到Nebula Graph时,nebula.write的配置才生效。
write:{
# Graph服务的IP地址和端口, 多个地址用英文逗号(,)分隔。格式: "ip1:port1,ip2:port2"。
# 使用docker-compose部署,端口需要填写docker-compose映射到外部的端口
# 可以用`docker-compose ps`查看
graphAddress: "192.168.*.11:9669"
# 所有Meta服务的IP地址和端口,多个地址用英文逗号(,)分隔。格式: "ip1:port1,ip2:port2"。
# 使用docker-compose部署,端口需要填写docker-compose映射到外部的端口
# 可以用`docker-compose ps`查看
metaAddress: "192.168.*.12:9559"
user:root
pswd:nebula
# 在提交图计算任务之前需要自行创建图空间及标签
# Nebula Graph图空间名称
space:nb
# Nebula Graph标签名称,图计算结果会写入该标签。标签中的属性名称固定如下:
# PageRank:pagerank
# Louvain:louvain
# ConnectedComponent:cc
# StronglyConnectedComponent:scc
# LabelPropagation:lpa
# ShortestPath:shortestpath
# DegreeStatic:degree、inDegree、outDegree
# KCore:kcore
# TriangleCount:tranglecpunt
# BetweennessCentrality:betweennedss
tag:pagerank
}
}
local: {
# 数据源。图计算的数据源为csv文件或json文件时,local.read的配置才生效。
read:{
filePath: "hdfs://127.0.0.1:9000/edge/work_for.csv"
# 如果CSV文件没有表头,使用[_c0, _c1, _c2, ..., _cn]表示其表头,有表头或者是json文件时,直接使用表头名称即可。
# 起始点ID列的表头。
srcId:"_c0"
# 目的点ID列的表头。
dstId:"_c1"
# 权重列的表头
weight: "_c2"
# csv文件是否有表头
header: false
# csv文件的分隔符
delimiter:","
}
# 数据落库。图计算结果落库到csv文件或text文件时,local.write的配置才生效。
write:{
resultPath:/tmp/
}
}
algorithm: {
# 需要执行的算法,可选值为:pagerank、louvain、connectedcomponent、
# labelpropagation、shortestpaths、degreestatic、kcore、
# stronglyconnectedcomponent、trianglecount、betweenness
executeAlgo: pagerank
# PageRank参数
pagerank: {
maxIter: 10
resetProb: 0.15 # 默认为0.15
}
# Louvain参数
louvain: {
maxIter: 20
internalIter: 10
tol: 0.5
}
# ConnectedComponent/StronglyConnectedComponent参数
connectedcomponent: {
maxIter: 20
}
# LabelPropagation参数
labelpropagation: {
maxIter: 20
}
# ShortestPath参数
shortestpaths: {
# several vertices to compute the shortest path to all vertices.
landmarks: "1"
}
# DegreeStatic参数
degreestatic: {}
# KCore参数
kcore:{
maxIter:10
degree:1
}
# TriangleCount参数
trianglecount:{}
# BetweennessCentrality参数
betweenness:{
maxIter:5
}
}
}
```
提交图计算任务。
${SPARK_HOME}/bin/spark-submit --master <mode> --class com.vesoft.nebula.algorithm.Main <nebula-algorithm-2.0.0.jar_path> -p <application.conf_path>
示例:
${SPARK_HOME}/bin/spark-submit --master "local" --class com.vesoft.nebula.algorithm.Main /root/nebula-spark-utils/nebula-algorithm/target/nebula-algorithm-2.0.0.jar -p /root/nebula-spark-utils/nebula-algorithm/src/main/resources/application.conf